为及时了解各地卫生系统内部审计工作情况，交流信息，促进工作开展，进一步推动卫生经济管理科学化、信息化建设，卫生部2012年建立了内部审计工作信息报告与通报制度。根据制度要求，各省（区、市）卫生行政主管部门和卫生部所属单位定期向卫生部上报内审工作情况。卫生部设计了专门的在线填报软件。各有关单位通过互联网直接在线上报。上报的内容包括：预算执行与决算、经济责任、财务收支、经济效益、专项资金、经济合同、基建和修缮项目等审计工作的数量、审计资金总额、查出有问题资金额度、提出审计处理意见建议条数、发现重大问题线索情况、移交纪检监察部门处理情况以及落实审计意见建议情况等。各省（区、市）每半年报送1次审计工作情况，卫生部预算单位每季度报送1次。据统计，2012年1-6月份，各地卫生系统（不含卫生部所属单位）开展专项审计8.7万余项。1-9月份，卫生部所属单位开展专项审计1.1万余项。

为发挥上报信息的作用，卫生部规划财务司专门汇总编发信息，在全国卫生系统范围内予以通报。（卫生部规划财务司）